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蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)(primarystructure)就是蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序(sequence),也是蛋白質(zhì)最基本的結(jié)構(gòu)。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序,通過肽鍵連接起來,成為多肽鏈,故肽鍵是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中的主鍵。
迄今已有約一千種左右蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)被研究確定,如胰島素,胰核糖核酸酶、胰蛋白酶等。
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定了蛋白質(zhì)的二級、三級等高級結(jié)構(gòu),成百億的天然蛋白質(zhì)各有其特殊的生物學活性,決定每一種蛋白質(zhì)的生物學活性的結(jié)構(gòu)特點,首先在于其肽鏈的氨基酸序列,由于組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸各具特殊的側(cè)鏈,側(cè)鏈基團的理化性質(zhì)和空間排布各不相同,當它們按照不同的序列關(guān)系組合時,就可形成多種多樣的空間結(jié)構(gòu)和不同生物學活性的蛋白質(zhì)分子。
氨基酸的連接方式
在蛋白質(zhì)分子中,氨基酸之間是以肽鍵(peptide bond)相連的。肽鍵就是一個氨基酸的α-羧基與另一個氨基酸的α-氨基脫水縮合形成的鍵。氨基酸之間通過肽鍵聯(lián)結(jié)起來的化合物稱為肽(peptide)。兩個氨基酸形成的肽叫二肽,三個氨基酸形成的肽叫三肽……,十個氨基酸形成的肽叫十肽,一般將十肽以下稱為寡肽(oligopeptide),以上者稱多肽(polypeptide)或稱多肽鏈。
組成多肽鏈的氨基酸在相互結(jié)合時,失去了一分子水,因此把多肽中的氨基酸單位稱為氨基酸殘基(amino acid residue)。
在多肽鏈中,肽鏈的一端保留著一個α-氨基,另一端保留一個α-羧基,帶α-氨基的末端稱氨基末端(N端);帶α-羧基的末端稱羧基末端(C端)。書寫多肽鏈時可用略號,N端寫于左側(cè),用H做標幟,C端于右側(cè)用桹H表示。
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